Второй Богатырский переулок расположен в районе Богородское на территории Восточного административного округа города Москвы. Переулок получил современное название по близости к заводу «Богатырь», позже переименованному в «Красный богатырь» (в настоящее время закрыт). До 1953 года (по другим данным — до 12 марта 1954 года) назывался Казаковский переулок.