Аптекарский переулок расположен в Басманном районе на территории Центрального административного округа города Москвы. Название известно с XVIII века. Получил название по находившейся в этой местности с 1702 года аптеке Ягана Готфрида Грегори и аптекарскому саду в Новой Немецкой слободе.