Малый Трёхгорный переулок расположен в Пресненском районе на территории Центрального административного округа города Москвы. Большой, Средний и Малый Трёхгорные переулки названы в конце XIX века по расположенной вблизи улицы Трехгорный Вал. Ранее Малый Трёхгорный именовался 2-й Никольский (1-м Никольским был тогда Средний Трёхгорный) по церкви Николая Чудотворца, что в Новом Ваганькове на Трёх горах и Ваганьковский (по селу Новое Ваганьково).
